В результате обследования несущих конструкций фонарика, самой высокой части собора, выполненного еще в 2009 году, были обнаружены дефекты и повреждения элементов его конструкций. В 2016 году были установлены леса, что позволило сделать обширные вскрытия для обследования облицовки, кровли и венчающего креста. В ходе работ выяснилось, что чугунные элементы несущих конструкций, а также железные соединительные элементы имеют коррозийные повреждения. Многочисленные дефекты и повреждения были обнаружены на элементах несущей конструкции креста и облицовке купола.
В текущем году с разрешения КГИОП фирмой ООО «Возрождение Петербурга» на фонарике ведутся работы по удалению пыли и ржавчины, замене утеплителя. Проведена разборка части креста и наружной медной обшивки со спуском и отправкой ее в мастерскую. В связи с реставрационными работами внутренней части фонарика выполнен демонтаж скульптуры голубя.
Работы будут завершены к декабрю 2018 года, после чего будет осуществлена разборка всех лесов.